Zazwyczaj zleca się je w przypadku podejrzenia jakichkolwiek schorzeń, związanych z tym narządem. Stanowi ono uzupełnienie diagnostyki w momencie wykrycia nieprawidłowości po badaniach laboratoryjnych. Warto wykonać je również, gdy w rodzinie pacjenta stwierdza się zachowania na choroby tarczycy, takie jak niedoczynność czy nadczynność. Wskazaniem do badania jest także widoczne powiększenie tarczycy, stwierdzone podczas badania palpacyjnego, problemu z połykaniem, duszności niewiadomego pochodzenia lub objawy takie jak nagły spadek lub wzrost wagi, rozdrażnienie, suchość skóry, kołatanie serca, ospałość czy problemy z koncentracją. USG tarczycy warto też wykonać w celach profilaktycznych lub z chęci skontrolowania swojego stanu zdrowia – szczególnie po usunięciu tarczycy lub jej operacji